• Türkçe
    • English
  • Türkçe 
    • Türkçe
    • English
  • Giriş
Öğe Göster 
  •   RTEÜ
  • Enstitüler
  • Fen Bilimleri Enstitüsü
  • Öğe Göster
  •   RTEÜ
  • Enstitüler
  • Fen Bilimleri Enstitüsü
  • Öğe Göster
JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

Acinetobacter baumannii izolatlarında antibiyotik direnç genlerinin taranması, Blages-22 ve Blaoxa-66 varyantlarının moleküler karakterizasyonu

Thumbnail

Göster/Aç

415368.pdf (12.08Mb)

Erişim

info:eu-repo/semantics/openAccess

Tarih

2015

Yazar

Saral, Ayşegül

Üst veri

Tüm öğe kaydını göster

Özet

Bu doktora tezinde, 101 Acinetobacter baumannii klinik suşunda direncin genetik mekanizmaları çalışıldı. blaOXA-51, blaOXA-23, blaOXA-40 ve blaOXA-58 benzeri genlerin tespiti için multipleks PZR kullanıldı. ISAba1, blaIMP, blaVIM, blaGES, blaVEB, blaPER-2, aac-3-Ia, aac-6'-Ib ve blaNDM-1 genleri PZR ve baz dizin analizi ile tespit edildi. Multipleks PZR'da, tüm suşların blaOXA-51, 79 suşun blaOXA-23 ve bir suşun blaOXA-40 taşıdığı tespit edildi. blaOXA-51 ve blaOXA-23 79 suşta birlikte bulundu. ISAba1 elementi 81 suşta tespit edildi ve tüm durumlarda blaOXA-51'in yukarı bölgesinde bulundu. GES tipi beta laktamazlar 24 suşta bulundu (16 suşta GES-11 ve 8 suşta GES-22). blaOXA-58, blaIMP, blaVIM, blaVEB, blaPER-2, ve blaNDM-1 genlerinin hiçbiri tespit edilmedi. aac-3-Ia ve aac-6'Ib genleri sırasıyla 13 ve 15 suşta tespit edildi. REP-PZR ile tüm suşlar 12 farklı grup altında toplandı. Türkiye'de A. baumannii'de GES-11 ve OXA-40 bulunması ilk kez rapor edildi. GES-22, GES-11'den bir amino asit substitüsyonu (M169L) ile farklılaşır. M169, sınıf A beta laktamazlarda substrat seçiciliğinde büyük etkileri olduğu bilinen omega halkasının bir parçası olduğundan GES-22 ifade edildi, saflaştırıldı ve kinetik olarak karakterize edildi. Bu çalışma, GES-11 ile karşılaştırıldığında GES-22'nin penisilinleri, sefotaksimi ve aztreonamı daha etkili hidroliz ettiğini seftazidime karşı etkinliğinin azaldığını gösterdi. Bunun yanı sıra, M169L substitüsyonu GES-22'nin klavulanik asit hidrolizinde daha etkili olmasına neden oldu. Bu sonuçların diğer sınıf A beta laktamazların homolog pozisyonlarında görülen diğer mutasyonlarınkine benzer olması metiyoninin sınıf A beta laktamazlarda substrat seçiciliğinde ve aktif bölge residülerinin sıralanmasında yapısal bir rol oynadığını düşündürdü. OXA-66 mutantları ifade edildi, saflaştırıldı ve kinetik olarak karakterize edildi. W222L, I129V, P130Q klinik mutasyonlarının OXA-66'da karbapenemlere karşı hidrolitik aktiviteyi arttırdığı gözlendi. Genetic mechanisms of resistance were determined in clinical strains of 101 Acinetobacter baumannii in this PhD thesis. Multiplex PCR was used for detecting blaOXA-51-like, blaOXA-23-like, blaOXA-40-like and blaOXA-58-like genes. ISAba1, blaIMP, blaVIM, blaGES, blaVEB, blaPER-2, aac-3-Ia, aac-6'-Ib and blaNDM-1 genes were detected by PCR and sequencing. By multiplex PCR, all strains carried blaOXA-51, 79 strains carried blaOXA-23 and one strain carried blaOXA-40. blaOXA-51 and blaOXA-23 were found together in 79 strains. ISAba1 element was detected in 81 strains, and in all cases it was found upstream of blaOXA-51. GES-type beta lactamases were found in 24 strains (GES-11 in 16 strains and GES-22 in 8 strains). blaOXA-58, blaIMP, blaVIM, blaVEB, blaPER-2, and blaNDM-1 genes were not observed. aac-3-Ia and aac-6'Ib genes were detected in 13 and 15 strains, respectively. All strains were collected into 12 different groups with REP-PCR. It was first reported that GES-11 and OXA-40 in A. baumannii from Turkey. GES-22 differs from GES-11 by a single amino acid substitution (M169L). Because M169 is part of the omega loop, a structure that is known to have major effects on substrate selectivity in class A ß-lactamases, GES-22 was expressed, purified and kinetically characterized. This study shows that compared to GES-11, GES-22 displays more efficient hydrolysis of penicillins, cefotaxime and aztreonam, but a loss of efficiency against ceftazidime. Additionally, the M169L substitution confers on GES-22 more efficient hydrolysis of the clavulanic acid. These effects are highly similar to other mutations at the homologous position in other class A ß-lactamases, suggesting that this methionine plays a key structural role in aligning active site residues and in substrate selectivity across the class. OXA-66 mutants were expressed, purified and kinetically characterized. It was observed that clinical mutations W222L, I129V, P130Q can increase the hydrolytic activity against carbapenems in OXA-66.

Bağlantı

https://hdl.handle.net/11436/383

Koleksiyonlar

  • Fen Bilimleri Enstitüsü [340]



DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 




| Yönerge | Rehber | İletişim |

DSpace@RTEÜ

by OpenAIRE
Gelişmiş Arama

sherpa/romeo

Göz at

Tüm DSpaceBölümler & KoleksiyonlarTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına GöreBu KoleksiyonTarihe GöreYazara GöreBaşlığa GöreKonuya GöreTüre GöreDile GöreBölüme GöreKategoriye GöreYayıncıya GöreErişim ŞekliKurum Yazarına Göre

Hesabım

GirişKayıt

İstatistikler

Google Analitik İstatistiklerini Görüntüle

DSpace software copyright © 2002-2015  DuraSpace
İletişim | Geri Bildirim
Theme by 
@mire NV
 

 


|| Rehber|| Yönerge || Kütüphane || Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi || OAI-PMH ||

Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi, Rize, Türkiye
İçerikte herhangi bir hata görürseniz, lütfen bildiriniz:

Creative Commons License
Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Institutional Repository is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 4.0 Unported License..

DSpace@RTEÜ:


DSpace 6.2

tarafından İdeal DSpace hizmetleri çerçevesinde özelleştirilerek kurulmuştur.