Genetic analysis of Aphaniidae Hoedeman, 1949 (Teleostei: Cyprinodontiformes) family in Anatolia

Abstract

We tested the mitochondrial DNA cytochrome b gene-based (1065 bp.) phylogeny and genetic diversity of tooth-carp fish (Aphaniidae Hoedeman, 1949), many of which are endemic, with a very high species diversity in Anatolia. A total of 107 individuals were studied from 29 stations belonging to 19 Aphaniid species and forty-four haplotypes were identified, all of which were species-specific. The phylogenetic relationships generated by neighbor joining, maximum likelihood and maximum parsimony methods are fully compatible with each other. The generally well supported phylogenetic tree results and genetic distance results supported a structure divided into four lineages corresponding to four genera (Anatolichthys, Paraphanius, Aphanius, and Kosswigichthys). The genetic distance between these four lineages indicated a significant value ranging from 16.6% (between Aphanius and Anatolichthys) to 23.1% (between Aphanius and Paraphanius). Interspecies genetic distances ranged from 1.9% (between P. boulengeri and P. similis) to 24.52% (between A. villwocki and P. mentoides), except for two interspecies distances (A. fontinalis – A. sureyanus, 0.13% and A. maeandricus – A. irregularis, 0.57%). Our results agree with previous studies of the Anatolian Aphaniidae family, which showed a diversification pattern shaped by Pliocene orogenic events. The present results indicate that mitochondrial DNA cytochrome b gene sequences are effective for Aphaniidae species identification and phylogenetic analysis

Anadolu'da çok yüksek tür çeşitliliğine sahip, çoğu endemik olan dişli sazancık balıklarının (Aphaniidae Hoedeman, 1949) mitokondri DNA sitokrom b genine (1065 bç.) dayalı filogenisini ve genetik çeşitliliğini test ettik. 19 Aphaniid türüne ait 29 istasyondan toplam 107 örnek incelendi ve türe özgü olan 44 haplotip tanımlandı. Komşu birleştirme, maksimum olabilirlik ve maksimum tutumluluk yöntemleriyle oluşturulan filogenetik ilişkiler birbiriyle tam uyumlu sonuçlar verdi. Genel olarak iyi desteklenen filogenetik ağaç sonuçları ve genetik uzaklık sonuçları, dört cinse (Anatolichthys, Paraphanius, Aphanius, and Kosswigichthys) karşılık gelen dört soydan oluşan bir yapıyı destekledi. Bu dört soy grubu arasındaki genetik mesafe %16,6 (Aphanius ve Anatolichthys) ile %23,1 (Aphanius ve Paraphanius) arasında değişen ciddi bir değer gösterdi. Türler arası genetik mesafeler iki tür grubu (A. fontinalis – A. sureyanus: %0.1 ve A. maeandricus – A. irregularis: %0.6) dışında %2.8 (P. boulengeri ve P.similis) ile %24.5 arasında (A. villwocki ile P. mentoides) arasında değişmektedir. Sonuçlarımız aynı zamanda, Pliyosen orojenik olaylarıyla şekillenen bir çeşitlenme modeli gösteren Anadolu Aphaniidae familyasının önceki çalışmalarıyla da uyumludur. Mevcut sonuçlar, mitokondriyal DNA sitokrom b gen dizilerinin Aphaniidae türlerinin tanımlanması ve filogenetik analizi için etkili olduğunu göstermektedir.